El Rey para poder gobernar América desde España creó una serie de instituciones organizadas en forma jerarquica que se establecieron tanto en América como en España, así el rey se le fue asiendo mas fácil gobernar los extensos territorios americanos.
Creó organizaciones para que funcionaran en España, como la Casa de Contratación la cual cumplía como función dar los permisos para vender, el comercio y navegación entre España y América,también otorgaba los permisos para llegar a un país o región para estableserce allí personas procedientes de otro,por otra parte organizaba la información geográfica para la creación de maspas.
Consejo de Indias que también fue una desición de Rey para que así le asesoraban al rey en la preparación de leyes; ordenanzas y reales células, esta fue creada en el año 1511 como un organismo legislativo, ejecutivo y judicial en asuntos relativos en América , resolvía en ultima instancia, como corte suprema de justicia, las apelaciones de lo fallos dictados en América. También sometia a los fucionarios a los juicios de recidencia como son los: oidores, cronistas, juaristas, cosmógrafos y capellanes, en donde se rendía cuenta de las tareas desempeñadas durante sus cargos en América.
Así el Rey con la ayuda del Virrey, que era designado por el rey siendo su representante en América, y el gobernador que tenía las mismas atribuciones y prohibiciones que el virrey, pero restringidas a su jurisdicción.El rey pudo gobernar de una muy buena manera inmensos territorios en América y Chile.
